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數據科學入門丨選Python還是R—CDA數據分析師

smartlion / 524人閱讀

摘要:我是德勤的數據科學家主管,多年來我一直在使用和語言,并且與社區密切合作了年。企業和個人偏好揭曉最終答案。其中超過的包都能用于數據科學。第一個在德勤使用的人他目前仍在公司工作,目前擔任首席數據科學家。

作者 Brian Ray
編譯 Mika
本文為 CDA 數據分析師原創作品,轉載需授權

對于想入門數據科學的新手來說,選擇學Python還是R語言是一個難題,本文對兩種語言進行了比較,希望能幫助你做出選擇。

我是德勤的數據科學家主管,多年來我一直在使用Python和R語言,并且與Python社區密切合作了15年。本文是我對這兩種語言的一些個人看法。

第三種選擇

針對這個問題,Studio的首席數據科學家Htley Wickham認為,比起在二者中選其一,更好的選擇是讓兩種語言合作。因此,這也是我提到的第三種選擇,我在文本最后部分會探討。

如何比較R和Python

對于這兩種語言,有以下幾點值得進行比較:

· 歷史:
R和Python的發展歷史明顯不同,同時有交錯的部分。

· 用戶群體:
包含許多復雜的社會學人類學因素。

· 性能:
詳細比較以及為何難以比較。

· 第三方支持:
模塊、代碼庫、可視化、存儲庫、組織和開發環境。

· 用例:
根據具體任務和工作類型有不同的選擇。

· 是否能同時使用:
在Python中使用R,在R中使用Python。

· 預測:
內部測試。

· 企業和個人偏好:
揭曉最終答案。

歷史

簡史:

ABC - > Python 問世(1989年由Guido van Rossum創立) - > Python 2(2000年) - > Python 3(2008年)

Fortan語言 - > S語言(貝爾實驗室) - > R語言問世(1991年由Ross Ihaka和Robert Gentleman創立) - > R 1.0.0(2000年) - > R 3.0.2(2013年)
社區

用戶群體

在比較Python與R的使用群體時,要注意:

只有50%的Python用戶在同時使用R

假設所有使用R語言的程序員都用R進行相關“科學和數字”研究。可以確定無論程序員的水平如何,這種統計分布都是真實。

這里回到第二個問題,有哪些用戶群體。整個科學和數字社區包含幾個子群體,當中存在一些重疊。

使用Python或R語言的子群體:

· 深度學習
· 機器學習
· 高級分析
· 預測分析
· 統計
· 探索和數據分析
· 學術科研
· 大量計算研究領域

雖然每個領域幾乎都服務于特定群體,但你會發現在統計和探索等方面,使用R語言更為普遍。在不久之前進行數據探索時,比起Python,R語言花的時間更少,而且使用Python還需要花時間進行安裝。

所有這一切都被稱為Jupyter Notebooks和Anaconda的顛覆性技術所改變。

Jupyter Notebook:增加了在瀏覽器中編寫Python和R代碼的能力;

Anaconda:能夠輕松安裝和管理Python和R。

現在,你可以在友好的環境中啟動和運行Python或R,提供開箱即用的報告和分析,這兩項技術消除了完成任務和選擇喜歡語言間的障礙。Python現在能以獨立于平臺的方式打包,并且更快地提供快速簡單的分析。

社區中影響語言選擇的另一個因素是“開源”的概念。不僅僅是開源的庫,還有協作社區對開源的影響。諷刺的是,Tensorflow和GNU Scientific Library等開源軟件(分別是Apache和GPL)都與Python和R綁定。雖然使用R語言的用戶很多,但使用Python的用戶中有很多純粹的Python支持者。另一方面,更多的企業使用R語言,特別是那些有統計學背景的。

最后,關于社區和協作,Github對Python的支持更多。如果看到最近熱門的Python包,會發現Tensorflow等項目有超過3.5萬的用戶收藏。但看到R的熱門軟件包,Shiny、Stan等的收藏量則低于2千。

性能

這方面不容易進行比較。

原因是需要測試的指標和情況太多。很難在任何一個特定硬件上測試。有些操作通過其中一種語言優化,而不是另一種。

循環

在此之前讓我們想想如何用Python與R對比。你真的想在R語言中做很多循環嗎?畢竟這兩種語言的意圖不太相同。

{
 "cells": [
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 1,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "import numpy as np
",
    "%load_ext rpy2.ipython"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 2,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "def do_loop(u1):
",
    "
",
    "    # Initialize `usq`
",
    "    usq = {}
",
    "
",
    "    for i in range(100):
",
    "      # i-th element of `u1` squared into `i`-th position of `usq`
",
    "      usq[i] = u1[i] * u1[i]
"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 3,
   "metadata": {},
   "outputs": [],
   "source": [
    "%%R
",
    "do_loop <- function(u1) {
",
    "    
",
    "    # Initialize `usq`
",
    "    usq <- 0
",
    "
",
    "    for(i in 1:100) {
",
    "      # i-th element of `u1` squared into `i`-th position of `usq`
",
    "      usq[i] <- u1[i]*u1[i]
",
    "    }
",
    "
",
    "}"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 4,
   "metadata": {},
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
     "output_type": "stream",
     "text": [
      "1.58 ms ± 42.8 μs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
"
     ]
    }
   ],
   "source": [
    "%%timeit -n 1000
",
    "%%R
",
    "u1 <- rnorm(100)
",
    "do_loop(u1)"
   ]
  },
  {
   "cell_type": "code",
   "execution_count": 5,
   "metadata": {},
   "outputs": [
    {
     "name": "stdout",
     "output_type": "stream",
     "text": [
      "36.9 μs ± 5.99 μs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
"
     ]
    }
   ],
   "source": [
    "%%timeit -n 1000
",
    "u1  = np.random.randn(100)
",
    "do_loop(u1)"
   ]
  }
 ],
 "metadata": {
  "kernelspec": {
   "display_name": "Python 3",
   "language": "python",
   "name": "python3"
  },
  "language_info": {
   "codemirror_mode": {
    "name": "ipython",
    "version": 3
   },
   "file_extension": ".py",
   "mimetype": "text/x-python",
   "name": "python",
   "nbconvert_exporter": "python",
   "pygments_lexer": "ipython3",
   "version": "3.6.3"
  }
 },
 "nbformat": 4,
 "nbformat_minor": 2
}

Python為0.000037秒,R為0.00158秒

包括加載時間和在命令行上運行:R需要0.238秒,Python需要0.147秒。強調,這并不是科學嚴謹的測試。

測試證明Python的運行速度明顯加快。通常這并沒有太大影響。

除了運行速度外,對于數據科學家而言哪種性能更重要?兩種語言之所以受歡迎是因為它們能被用作命令語言。例如,在使用Python時大多時候我們都很依賴Pandas。這就涉及到每種語言中模塊和庫,以及其執行方式。

第三方支持

Python有PyPI,R語言有CRAN,兩者都有Anaconda。

CRAN使用內置的install.packages命令。目前,CRAN上有大約1.2萬個包。其中超過1/2的包都能用于數據科學。

PyPi中包的數量超過前者的10倍,約有14.1萬個包。專門用于科學工程的有3700個。其中有些也可以用于科學,但沒有被標記。

在兩者中都有重復的情況。當搜索“隨機森林”時,PyPi中可以得到170個項目,但這些包并不相同。

盡管Python包的數量是R的10倍,但數據科學相關的包的數量大致相同。

運行速度

比較DataFrames和Pandas更有意義。

我們進行了一項實驗:比較針對復雜探索任務的執行時間,結果如下:

在大多數任務中Python運行速度更快。

來源:
http://nbviewer.jupyter.org/g...

可以看到,Python + Pandas比原生的R語言DataFrames更快。注意,這并不意味著Python運行更快,Pandas 是基于Numpy用C語言編寫的。

可視化

這里將ggplot2與matplotlib進行比較。
matplotlib是由John D. Hunter編寫的,他是我在Python社區中最敬重的人之一,他也是教會我使用Python的。

Matplotlib雖然不易學習但能進行定制和擴展。ggplot難以進行定制,有些人認為它更難學。

如果你喜歡漂亮的圖表,而且無需自定義,那么R是不錯的選擇。如果你要做更多的事情,那么Matplotlib甚至交互式散景都不錯。同樣,R的ShinnyR能夠增加交互性。

是否能同時使用

可能你會問,為什么不能同時使用Python和R語言?

以下情況你可以同時使用這兩種語言:

· 公司或組織允許;
· 兩種都能在你的編程環境中輕松設置和維護;
· 你的代碼不需要進入另一個系統;
· 不會給合作的人帶來麻煩和困擾。

一起使用兩種語言的方法是:

· Python提供給R的包:如rpy2、pyRserve、Rpython等;

· R也有相對的包:rPython、PythonInR、reticulate、rJython,SnakeCharmR、XRPython

· 使用Jupyter,同時使用兩者,例子如下:

之后可以傳遞pandas的數據框,接著通過rpy2自動轉換為R的數據框,并用“-i df”轉換:

來源:
http://nbviewer.jupyter.org/g...

預測

Kaggle上有人對開發者使用R還是Python寫了一個Kernel。他根據數據發現以下有趣的結果:

· 如果你打算明年轉向Linux,則更可能是Python用戶;

· 如果你研究統計數據,則更可能使用R;如果研究計算機科學,則更可能使用Python;

· 如果你還年輕(18-24歲),則更可能是Python用戶;

· 如果你參加編程比賽,則更可能是Python用戶;

· 如果你明年想使用Android,則更可能是Python用戶;

· 如果你想在明年學習SQL,則更可能是R用戶;

· 如果你使用MS office,則更可能是R用戶;

· 如果你想在明年使用Rasperry Pi,則更可能是Python用戶;

· 如果你是全日制學生,則更可能是Python用戶;

· 如果你使用的敏捷方法(Agile methodology),則更可能是Python用戶;

· 如果對待人工智能,比起興奮你更持擔心態度,則更可能是R用戶。

企業和個人偏好

當我與Googler和Stack Overflow的大神級人物Alex Martelli交流時,他向我解釋了為什么Google最開始只官方只是少數幾種語言。即使是在Google相對開發的環境中,也存在一些限制和偏好,其他企業也是如此。

除了企業偏好,企業中第一個使用某種語言的人也會起到決定性作用。第一個在德勤使用R的人他目前仍在公司工作,目前擔任首席數據科學家。我的建議是,選擇你喜歡的語言,熱愛你選擇的語言,起到領導作用,并熱愛你的事業。

當你在研究某些重要的內容時,犯錯是難以避免的。然而,每個精心設計的數據科學項目都為數據科學家留有一些空間,讓他們進行實驗和學習。重要的是保持開放的心態,擁抱多樣性。

最后就我個人而言,我主要使用Python,之后我期待學習更多R的內容。

原文鏈接:
https://blog.usejournal.com/p...

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