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基于R和Python的極大似然估計的牛頓法實現

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摘要:本文以牛頓法為例給出求解分布分布的極大似然估計參數的理論并使用和實現。如果隨機變量獨立同分布于且已知一組樣本為了估計該分布的參數,可以使用極大似然估計的方法。

目錄

0.前言

1.理論基礎

2.Cauchy分布的極大似然估計

2.1理論基礎

2.2算法

2.2.1R語言實現

2.2.2Python語言實現

3.Gamma 分布的極大似然估計

3.1理論基礎

3.2算法

3.2.1R語言實現

3.2.2Python語言實現


0.前言

? ? ? ? 最近在學習Theory and Method of Statistics(統計理論方法),使用的教材是由Bradley Efron 、Trevor Hastie共同編寫的Computer Age Statistical Inference: Algorithms, Evidence, and Data Science(《計算機時代的統計推斷:算法、演化和數據科學》)。書中第四章講述的Fisherian Inference and Maximum Likelihood Estimation(費雪推斷和極大似然估計),其中提到現實應用中極大似然估計并沒有那么容易求解,比如Cauchy分布Gamma分布。

????????如果極大似然估計方法沒有顯式解,可以考慮用數值計算的方法求解(如牛頓法);更進一步,如果二階導不存在或Hessian矩陣非正定,可以使用擬牛頓法;再復雜一些,可以使用MM算法(EM是MM的特例)? 。本文以牛頓法為例,給出求解?Cauchy分布、Gamma分布的極大似然估計參數的理論并使用R和Python實現。

1.理論基礎

? ? ? ? 本節給出牛頓法求分布的極大似然參數估計的一般理論。

????????如果隨機變量?獨立同分布于,且已知一組樣本? ,為了估計該分布的參數,可以使用極大似然估計的方法。

?????? 首先寫出樣本的似然函數

?????? 對? 進行對數化處理,得到對數似然函數

?????? 則求解未知參數等價于求解以下等式方程組

?????? 不妨假設收斂解為? ,將在? 的鄰域內展開成泰勒級數得

?????? 這樣就得到一個迭代關系式

?????? 如果是連續的,并且待求的零點是孤立的,那么在零點周圍存在一個區域,只要初始值位于這個鄰近區域內,那么牛頓法必定收斂。 并且,如果不為0, 那么牛頓法將具有平方收斂的性能。 粗略地說,這意味著每迭代一次,牛頓法結果的有效數字將增加一倍。

2.Cauchy分布的極大似然估計

????????如果隨機變量服從柯西分布,記為 ,其中為最大值一半處的一半寬度的尺度參數(scale parameter ),為定義分布峰值位置的位置參數(location parameter )

?????? 當 ,此時的Cauchy 分布稱為標準Cauchy 分布

?????? Cauchy 分布的最特別的性質是其期望及高階矩都不存在,自然也就無法對參數進行矩估計。但Cauchy分布的cdf具有很好的性質,可以利用一組樣本的分位點來對參數進行點估計。

2.1理論基礎

? ? ? ? 使用極大似然方法估計,已知樣本

? ? ? ? 故迭代公式為

2.2算法

Step0:給定,,停止精度

Step1:計算 ,如果

?????? 則終止,否則進行下一步

Step2:計算 ,令

Step3:計算,?跳轉Step1

2.2.1R語言實現

# 設立牛頓算法框架Newtons = function(fun, x, theta,ep = 1e-5, it_max = 100){  index = 0 ;k = 1  while (k <= it_max){    theta1 = theta    obj = fun(x,theta)    theta = theta - solve(obj$J,obj$f)    norm = sqrt((theta - theta1) %*% (theta - theta1))    if (norm < ep){      index = 1; break    }    k = k + 1  }  obj = fun(x,theta)  list(root = theta, it = k, index = index, FunVal = obj$f)}# 計算hessian矩陣和一階導數funs = function(x,theta){  n = length(x)  temp_1 = (x-theta[2])^2+theta[1]^2  temp_2 = (x-theta[2])^2-theta[1]^2  f = c(n/theta[1]-sum(2*theta[1]/temp_1),          sum((2*(x-theta[2]))/temp_1))  J = matrix(c(-n/theta[1]^2-sum(2*temp_2/temp_1^2), -sum((4*theta[1]*(x-theta[2]))/temp_1^2),                -sum((4*theta[1]*(x-theta[2]))/temp_1^2),sum(2*temp_2/temp_1^2)), nrow = 2, byrow = T)  list(f = f, J = J)}# 抽取1000個樣本set.seed(80)sample = rcauchy(1000,scale = 2,location = 2)# 計算cauchy分布參數的分位數估計作為初始值gamma_ = quantile(sample,0.75) - median(sample)theta_ = median(sample)theta = c(gamma_,theta_)Newtons(funs,sample,theta)

2.2.2Python語言實現

import numpy as npimport scipy.stats as stnp.random.seed(12)sample = st.cauchy.rvs(loc=1,scale = 1,size = 100) # scipy.stats.cauchy.rvs(loc=0, scale=1, size=1, random_state=None)gamma_ = np.quantile(sample,0.75) - np.median(sample)theta_ = np.median(sample)theta = np.array([gamma_,theta_])def Newtons(fun,x,theta,ep=1e-5,it_max = 100):    index = 0    k = 1    while k <= it_max:        theta1 = theta        obj = fun(x,theta)        theta = theta - np.dot(np.linalg.inv(obj[1]),obj[0])        norm = np.sqrt(np.sum((theta - theta1)**2))        if norm < ep:            index = 1            break        k = k+1    obj = fun(x,theta)    print("gamma,theta估計值為%.3f,%.3f"%(theta[0],theta[1]))def funs(x,theta):    n = len(x)    temp_1 = (x - theta[1]) ** 2 + theta[0] ** 2    temp_2 = (x - theta[1]) ** 2 - theta[0] ** 2    f = np.array([n/theta[0]-np.sum(2*theta[0]/temp_1),                  np.sum((2*(x-theta[1]))/temp_1)])    j = np.array([[-n/theta[0]**2-sum(2*temp_2/temp_1**2),-np.sum((4*theta[0]*(x-theta[1]))/temp_1**2)],                  [-np.sum((4*theta[0]*(x-theta[1]))/temp_1**2),sum(2*temp_2/temp_1**2)]])    return [f,j]Newtons(funs,sample,theta)

3.Gamma 分布的極大似然估計

????????如果隨機變量 服從Gamma分布,記為,其中為形狀參數(shape parameter),β 為尺度參數(scale parameter ),λ 為位置參數(location parameter)

? ? ? ? 為了給出Gamma分布三個參數的矩估計,現考慮分布的一二三階原點矩(求解的技巧在于湊Gamma函數)

? ? ? ? 以一階原點矩的證明為例,將x拆分為

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

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? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??

?①? ?? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

? ? ? ? 對于二階三階原點矩,分別將拆分為

? ? ? ? 易得

? ? ? ? 又

? ? ? ? 由①②③可得

3.1理論基礎

? ? ? ? 已知樣本,參數

? ? ? ? 故迭代公式為

3.2算法

Step0:給定,,停止精度

Step1:計算 ,如果

?????? 則終止,否則進行下一步

Step2:計算 ,令

Step3:計算,?跳轉Step1

3.2.1R語言實現

# 設立牛頓算法框架Newtons = function(fun, x, theta,ep = 1e-5, it_max = 100){  index = 0; k = 1  while (k <= it_max ){    theta1 = theta; obj = fun(x,theta)    theta = theta - solve(obj$J,obj$f)    norm = sqrt((theta - theta1) %*% (theta - theta1))    if (norm < ep){      index = 1; break    }    k = k + 1  }  obj = fun(x,theta)  list(root = theta, it = k, index = index, FunVal = obj$f)}# 計算hessian矩陣和一階導數funs = function(x,theta){  n = length(x)  f = c(-n*log(theta[2])-n*digamma(theta[1])+sum(log(x-theta[3])),          -n*theta[1]/theta[2]+1/(theta[2]^2)*sum(x-theta[3]),         (theta[1]-1)*sum(-1/(x-theta[3]))+n/theta[2])  J = matrix(c(-n*trigamma(theta[1]), -n/theta[2], sum(-1/(x-theta[3])),                -n/theta[2],n*theta[1]/(theta[2]^2)-2/(theta[2]^3)*sum(x-theta[3]),-n/(theta[2]^2),                sum(-1/(x-theta[3])),-n/(theta[2]^2),(theta[1]-1)*sum(-1/(x-theta[3])^2)), nrow = 3, byrow = T)  list(f = f, J = J)}# 抽取隨機gammaset.seed(80)sample = rgamma(100,2,)# 計算gamma分布參數的矩估計作為初始值s_m = mean(sample)s_v = var(sample)m_3 = (sum((sample-s_m)^3))/length(sample)alpha = (4*(s_v)^3)/(m_3^2)beta = m_3/(2*s_v)lambda = s_m-2*((s_v)^2/m_3)theta = c(alpha,beta,lambda)Newtons(funs,sample,theta)

3.2.2Python語言實現

import numpy as npimport scipy.stats as stimport scipy.special as spnp.random.seed(12)sample = st.gamma.rvs(2,scale = 1,size = 50) # scipy.stats.gamma.rvs(a, loc=0, scale=1, size=1, random_state=None)s_m = sample.mean()s_v =sample.var()m_3 = np.mean(((sample - s_m)**3))alpha = (4*(s_v)**3)/(m_3**2)beta = m_3/(2*s_v)lambda_ = s_m-2*((s_v)**2/m_3)theta = np.array([alpha,beta,lambda_])def Newtons(fun,x,theta,ep=1e-5,it_max = 100):    index = 0    k = 1    while k <= it_max:        theta1 = theta        obj = fun(x,theta)        theta = theta - np.dot(np.linalg.inv(obj[1]),obj[0])        norm = np.sqrt(np.sum((theta - theta1)**2))        if norm < ep:            index = 1            break        k = k+1    obj = fun(x,theta)    print("alpha,beta,lambda估計值為%.3f,%.3f,%.3f"%(theta[0],theta[1],theta[2]))def funs(x,theta):    n = len(x)    f = np.array([-n*np.log(theta[1])-n*sp.digamma(theta[0])+np.sum(np.log(x-theta[2])),                  -n*theta[0]/theta[1]+1/(theta[1]**2)*np.sum(x-theta[2]),                  (theta[0]-1)*np.sum(-1.0/(x-theta[2]))+n/theta[1]])    j = np.array([[-n*sp.polygamma(1,theta[0]),-n/theta[1],np.sum(-1/(x-theta[2]))],                  [-n/theta[1],n*theta[0]/(theta[1]**2)-2/(theta[1]**3)*np.sum(x-theta[2]),-n/(theta[1]**2)],                  [np.sum(-1/(x-theta[2])),-n/(theta[1]**2),(theta[0]-1)*np.sum(-1/(x-theta[2])**2)]])    return [f,j]Newtons(funs,sample,theta)

注意:對Gamma分布三參數的極大似然估計過程中,如果使用牛頓法,很容易出現矩陣不正定的情況從而無法得到正確解,這個時候可以使用擬牛頓法或者修正的牛頓法。

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